■ 基本信息

孙凤明，1986年出生，遗传学博士，副研究员/特聘副教授，硕士研究生导师。

 

■ 联系方式

电子邮箱：sunfengming@cqmu.edu.cn

 

■ 学习与工作经历

2006.09-2010.07 东北林业大学，理学学士

2010.07-2011.09 深圳华大基因研究院，研究实习员，基因组学及生物信息学研究

2011.09-2013.11 香港中文大学，基因组学与生物信息学硕士

2013.11-2014.03 深圳华大基因研究院，助理研究员，基因组学及生物信息学研究

2014.03-2017.06 中国农业科学院油料作物研究所，助理研究员，基因组学研究

2017.06-2019.09 西南医院，副研究员，病原微生物及疾病基因组遗传学研究

2019.09-2022.07 陆军军医大学（原第三军医大学），遗传学博士

2022.07-2023.11 西南医院感染病科，副研究员，病原微生物及疾病基因组遗传学研究

2023.11-至今 重庆医科大学检验医学院，副教授，硕士研究生导师

 

■ 研究方向

1. 疾病分子检测标志物、病原微生物临床检测技术研究

2. 重症感染性疾病的遗传致病机制研究

3. 生物信息学在检验医学中的应用

 

■ 科研项目

1. 国家自然科学基金面上项目，基于蛋白特征序列模式广泛鉴定人基因组HERV元件env内源性超抗原的研究，32370663，2024.01-2027.12，50万元，在研，主持；

2. 陆军军医大学苗圃人才计划，感染性疾病基因组遗传致病机制研究，2019.7至2023年10月，32万元，主持；

3. 致病微生物特征序列标签库的构建及初步验证，其他来源课题，2018.01-2019.12，30万元，结题，主持；

4. 基于靶向扩增体系建立虫媒病原体检测技术，其他来源课题，2019.01-2021.12，60万元，结题，主持；

5. HBV特异性TNF-α+ CD4 Tscm新亚群介导免疫损伤/保护的机制及干预策略研究，国家自然科学基金委员会-重点项目， 297万，2020-01-01至今在研，骨干参与；

6. 重庆新型冠状病毒感染的特征规律研究，重庆市卫生健康委员会，2020-02-01至2020-12-31，100万元，结题，骨干参与；

7. 艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治科技重大专项，科技部-重大专项，2019-01-01至2020-12-31，500万元，结题，骨干参与。

■ 学术论著

1. Sun, Fengming; Wang, Xiuhua; Tan, Shun; Dan, Yunjie; Lu, Yanqiu; Zhang, Juan; Xu, Junli; Tan, Zhaoxia; Xiang, Xiaomei; Zhou, Yi; He, Weiwei; Wan, Xing; Zhang, Wei; Chen, Yaokai; Tan, Wenting; Deng, Guohong ; SARS-CoV-2 Quasispecies Provides an Advantage Mutation Pool for the Epidemic Variants, MICROBIOLOGY SPECTRUM,2021,9(1): 1-16 (第一作者)

2. Sun, Fengming; Tan, Wenting; Dan, Yunjie; Wang, Xiuhua; Guo, Yanzhi; Deng, Guohong ; Copy number gain of pro-inflammatory genes in patients with HBV-related acute-on-chronic liver failure, BMC MEDICAL GENOMICS,2020,13(1): 1-9(第一作者)

3. Li, Fuguang; Fan, Guangyi; Wang, Kunbo; Sun, Fengming; Yuan, Youlu; Song, Guoli; Li, Qin; Ma, Zhiying; Lu, Cairui; Zou, Changsong; Chen, Wenbin; Liang, Xinming; Shang, Haihong; Liu, Weiqing; Shi, Chengcheng; Xiao, Guanghui; Gou, Caiyun; Ye, Wuwei; Xu, Xun; Zhang, Xueyan; Wei, Hengling; Li, Zhifang; Zhang, Guiyin; Wang, Junyi; Liu, Kun; Kohel, Russell J.; Percy, Richard G.; Yu, John Z.; Zhu, Yu-Xian; Wang, Jun; Yu, Shuxun;Genome sequence of the cultivated cotton Gossypium arboreum,NATURE GENETICS,2014,46(6): 567-572 (共同第一作者)

4. Sun, Fengming; Liu, Jing; Hua, Wei; Sun, Xingchao; Wang, Xinfa; Wang, Hanzhong ; Identification of stable QTLs for seed oil content by combined linkage and association mapping in Brassica napus,PLANT SCIENCE,2016,252: 388-399 (第一作者)

5. Zhou, Xuming;Sun, Fengming; Xu, Shixia; Fan, Guangyi; Zhu, Kangli; Liu, Xin; Chen, Yuan; Shi, Chengcheng; Yang, Yunxia; Huang, Zhiyong; Chen, Jing; Hou, Haolong; Guo, Xuejiang; …; Wang, Junyi; Pan, Shengkai; Fang, Xiaodong; Li, Ming; Wei, Fuwen; Xu, Xun; Zhou, Kaiya; Wang, Jun; Yang, Guang;Baiji genomes reveal low genetic variability and new insights into secondary aquatic adaptations, NATURE COMMUNICATIONS,2013,4 (共同第一作者)

6. Sun, Fengming; Fan, Guangyi; Hu, Qiong; Zhou, Yongming; Guan, Mei; Tong, Chaobo; Li, Jiana; Du, Dezhi; Qi, Cunkou; Jiang, Liangcai; Liu, Weiqing; Huang, Shunmou; Chen, Wenbin; …; Liu, Xin; Chalhoub, Boulos; Hua, Wei; Wang, Hanzhong ; The high-quality genome of Brassica napus cultivar 'ZS11' reveals the introgression history in semi-winter morphotype,PLANT JOURNAL,2017,92(3): 452-468(第一作者)

7. Wang, Yun; Fan, Guangyi; Liu, Yiman; Sun, Fengming; Shi, Chengcheng; Liu, Xin; Peng, Jing; Chen, Wenbin; Huang, Xinfang; Cheng, Shifeng; Liu, Yuping; Liang, Xinming; Zhu, Honglian; …; Tan, Benzhong; Lin, Chufa; Mu, Feng; Xu, Xun; Ding, Yi; Guo, An-Yuan; Wang, Jun; Ke, Weidong;The sacred lotus genome provides insights into the evolution of flowering plants, PLANT JOURNAL,2013,76(4): 557-567 (共同第一作者)

8. Chalhoub, Boulos; Denoeud, France; Liu, Shengyi; Parkin, Isobel A. P.; Tang, Haibao; Wang, Xiyin; Chiquet, Julien; Belcram, Harry; Tong, Chaobo; Samans, Birgit; …; Sun, Fengming; Lim, Yong Pyo;…; Zhou, Yongming; Hua, Wei; Sharpe, Andrew G.; Paterson, Andrew H.; Guan, Chunyun; Wincker, Patrick;Early allopolyploid evolution in the post-Neolithic Brassica napus oilseed genome,SCIENCE,2014,345(6199): 950-953（参与）

9. Cai, Jing; Liu, Xin; Vanneste, Kevin; Proost, Sebastian; Tsai, Wen-Chieh; Liu, Ke-Wei; Chen, Li-Jun; He, Ying; Xu, Qing; Bian, Chao; Zheng, Zhijun; Sun, Fengming; Liu, Weiqing; …; Luo, Yi-Bo; Chen, Hong-Hwa; de Peer, Yves Van; Liu, Zhong-Jian; The genome sequence of the orchid Phalaenopsis equestris, NATURE GENETICS,2015,47(1): 65（参与）

10. Li, Fuguang; Fan, Guangyi; Lu, Cairui; Xiao, Guanghui; Zou, Changsong; Kohel, Russell J.; Ma, Zhiying; Shang, Haihong; Ma, Xiongfeng; …; Sun, Fengming; Wang, Xingfen; Liang, Jie; Wang, Jiahao; He, Qiang; Huang, Leihuan; Wang, Jun; Cui, Jinjie; Song, Guoli; Wang, Kunbo; Xu, Xun; Yu, John Z.; Zhu, Yuxian; Yu, Shuxun ; Genome sequence of cultivated Upland cotton (Gossypium hirsutum TM-1) provides insights into genome evolution,NATURE BIOTECHNOLOGY,2015,33(5): 524-U242（参与）

 

■ 专利

1. 谭文婷，邓国宏，但芸婕，孙凤明。基于高通量测序构建多种血友病靶向文库的引物合成、方法及试剂盒。国家发明专利，授权日期2020年7月17日，ZL201811389643.4。

2. 邓国宏，谭文婷，但芸婕，孙凤明，王修华。多种遗传代谢性肝病靶向文库的引物组合、方法及试剂盒。国家发明专利，授权日期2020年8月4日，ZL201811388560.3。

3. 软件著作权：以第一完成人开发两套临床病源检测分析软件，且获得软件著作权（2018SR682180和2018SR686632）。