检验医学院坚持面向世界科技前沿、面向重大战略需求、面向人民生命健康，以新医科建设为统领，瞄准学科发展的前沿与方向，开展“产学研用”集成创新，重点围绕“精准、快速临床检测新方法、新技术”和“重大疾病诊断标志物研究（集中在感染性疾病、肿瘤和代谢性疾病3个方向）”开展系统深入科学研究。现有临床检验诊断学教育部重点实验室、重庆医科大学国际体外诊断研究院、重庆市医学检验微流控及SPRi工程技术中心和博士后科研流动站等高水平研究平台。

近五年，学院先后承担了国家重点研发计划“政府间国际科技创新合作/港澳台科技创新合作”重点专项项目，国家传染病防治重大专项（子课题），国家重点研发计划“生物安全关键技术研究”重点专项（子课题），“十四五”国家重点研发计划“生物大分子与微生物组”重点专项（子课题）；国家自然科学基金重点项目、国际合作项目、区域联合重点项目、面上项目、青年基金等国家级和省部级以上科研项目共75项。累计获批科研经费6000多万元，年均获批1200余万元，项目经费和数量持续增长。研究成果在Nature Medicine、Nucleic Acids Research、Nature communication、Science advances、Journal of Hematology & Oncology、ACS Nano、Journal of Extracellular Vesicles等国际知名杂志共发表SCI/EI论文337篇，其中IF≥10分的55篇，IF≥5分的201篇，IF最高值为87.21分。近5年学院获得授权中国发明专利26项，授权国际发明专利3项，获省部级科技奖励4项。

学院高度重视国际学术交流，长期与美国芝加哥大学、不列颠哥伦比亚大学、香港中文大学、北京大学、中国科学院生物化学干细胞生物学研究所等国内外知名高校、体外诊断企业、国内知名三甲医院和第三方医学检验机构保持密切合作，开展学术交流。